Rakennebiologian kansainvälinen tohtori

International Doctorate in Structural Biology on kansainvälinen tohtorintutkinto yhteistyössä Frankfurtin ja Utrechtin yliopistojen kanssa. Se perustettiin kolmen rehtorin vuonna 2001 allekirjoittamalla sopimuksella. Tämän sopimuksen perusteella opiskelijoiden ohjelman päätteeksi saama tohtorintutkinto katsotaan vastaavaksi Bijvoetin biomolekyylitutkimuskeskuksessa hankittua arvoa ja tohtorintutkintoa. kemian ja biokemian tutkinto Frankfurtin yliopistosta.

Tohtorikurssin tavoitteena on muodostaa tohtoreita, jotka ovat tietämyksen ja koulutuksen kärjessä rakennebiologian, biotekniikan ja systeemibiologian nykyaikaisten tutkimusmenetelmien alalla. Se tarjoaa runsaasti tietoa asiantuntijoiden koulutukseen rakennekemian alalla, jota sovelletaan biologisiin makromolekyyleihin liuoksessa, fibrilleissä, kalvoissa tai soluissa, sekä molekyylibiologian alalla isotooppisesti rikastettujen rekombinanttiproteiinien ilmentämiseksi.

Isäntälaitos

University of Florence magneettiresonanssikeskus (CERM) on Euroopan komission tukema tutkimusinfrastruktuuri, joka tarjoaa kansainvälisen pääsyn biologiseen NMR:ään. CERM on yksi maailman ensimmäisistä laboratorioista, jotka mittaavat laitteiden laatua, tuotantoa ja tieteellistä uskottavuutta rakennebiologian ja NMR:n alalla. Infrastruktuuri on ainutlaatuisesti varustettu suurella määrällä NMR-spektrometrejä 1200 MHz:stä 0,01 MHz:iin aina 950, 900, 850 WB, 800, 700, 600, 500 ja 400 MHz spektrometreihin. Monet näistä instrumenteista on varustettu kryoanturilla. Sillä on erikoistunut perinne metalloproteiinien, erityisesti paramagneettisten metalloproteiinien, tutkimukseen. CERM on INSTRUCTin, integroidun rakennebiologian eurooppalaisen infrastruktuurin, ydinjäsen, joka sisältää huipputeknologian, tieteellisen asiantuntemuksen ja koulutuksen keskuksia.

Opiskelijat koulutetaan biologian ja epäorgaanisen kemian rajapinnasta biolaskennan ja spektroskopian avulla. Pitkän aikavälin koulutuksen tavoitteena on luoda tiedemiehiä, jotka pystyvät määrittelemään erityisongelmia yleisessä kontekstissa, pitämään monitieteisyyttä ensisijaisena tarpeena ja pitämään kansainvälistä yhteistyötä edellytyksenä yhtenäisen eurooppalaisten tutkijoiden sukupolven kehittämiseksi.

Kurssin pohjana olevat aineet ovat:

• Ydinmagneettinen resonanssi (liuoksessa ja kiinteässä tilassa) ja röntgenkristallografia biologisten makromolekyylien rakennetutkimuksiin, toimintoihin ja dynamiikkaan, proteiini-proteiini-vuorovaikutuksiin;
• Molekyylibiologian ja solubiologian tekniikat proteiinien, DNA:n ja bakteerikonsortioiden valmisteluun ja käsittelyyn;
• uusien lääkkeiden kehittäminen lääkesuunnittelutekniikoiden avulla;
• Bioinformatiikka perusstrategiana kineettisten ja termodynaamisten ilmiöiden ja proteiinidynamiikan tutkimuksessa, oppimiseen ja kehittämiseen genomitietokantojen käyttöä varten molekyylikohteiden tunnistamiseksi uusien lääkkeiden kehittämisessä;
• metabolomiikka.

Tohtoriohjelma perustuu tutkimusryhmien yhteistyöhön Utrechtin, Frankfurtin, Lyonin ja Oxfordin yliopistoista, jotka ovat maailman merkittävimpiä rakennebiologian alalla.

Kurssin tavoitteena on tarjota laadukas ja monialainen tutkimuskoulutus rakennebiologian alalla. Tämän saavuttamiseksi kurssi sisältää erittäin laajan integroidun ohjelman, joka kattaa kemian, biologian, biofysiikan, lääketieteen ja informatiikan asiantuntemuksen ja pystyy vastaamaan alan todellisiin haasteisiin peruskysymyksistä sovelluksiin. Uuden sukupolven tohtoriopiskelijat koulutetaan pitämään monitieteistä tutkimusta, kansainvälistä yhteistyötä ja eri tekniikoiden integrointia ensisijaisina tarpeina erinomaisen tutkimuksen kehittämisessä.

Rakennebiologia on avain innovaatioille bioteknologiassa, elintarviketeknologiassa ja biolääketieteen sovelluksissa. Sillä on tärkeä rooli terapeuttisten aineiden vaikutustavan ymmärtämisessä ja se helpottaa tiettyihin molekyylikohteisiin vaikuttavien innovatiivisten lääkkeiden ja biologisten aineiden suunnittelua. Alkaen makromolekyylien kolmiulotteisten rakenteiden määrittämisestä, rakennebiologia on kehittynyt makromolekyylidynamiikan ja makromolekyylimekanismien tutkimukseen ja niiden sijoittamiseen solukonteksteihin. Se tarjoaa atomitason visualisoinnin biomolekyyleistä ja niiden toimintatavoista. Lääkeyhtiöillä on rakennebiologian osastot, jotka ovat mukana lääkekeksintöjen eri vaiheissa. Itse asiassa sellaiset alueet, kuten tietoon perustuvat lääkkeet ja uudet rokotteet, riippuvat usein ratkaisevasti rakenteellisista tiedoista.

Suurempia ja suurempia molekyylisysteemejä ja yhä monimutkaisempia biologisia ilmiöitä odotetaan tulevaisuuden paljastavan integratiivisten rakennebiologian lähestymistapojen avulla, jotka yhdistävät toisiaan täydentäviä kokeellisia ja laskennallisia työkaluja.

Ehdokkaat koulutetaan sitä varten

• hankkia vankan yhteisen tieteellisen taustan rakennebiologian alueella,
• saavat edistyneen ja kohdennetun infrastruktuuripohjaisen koulutuksen tutkimusmetodologiassaan
• Osallistua ja edistää tutkimustaan kansainvälisissä konferensseissa
• tiedottaa työnsä tuloksista kansainvälisissä julkaisuissa
• laajentaa näköalojaan lukuisten kurssien ja seminaarien avulla
• edistää tieteidenvälistä yhteistyötä
• edistää liikkuvuutta ja kansainvälistä yhteistyötä
• Hanki ei-tieteellistä koulutusta parantaaksesi uranäkymiä
• kehittyä ammattitaitoisiksi, ennakkoluulottomasti ja itsenäisiksi nuoriksi tutkijoiksi.